開放閱讀框
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開放閱讀框（英語：Open reading frame；縮寫：ORF；其他譯名：開放閱讀框架、開放讀架等）是指在給定的閱讀框架中，不包含終止密碼子的一串序列。這段序列是生物個體的基因組中，可能作為蛋白質(zhì)編碼序列的部分。基因中的ORF包含并位于開始編碼與終止編碼之間。由于一段DNA或RNA序列有多種不同讀取方式，因此可能同時存在許多不同的開放閱讀框架。有一些電腦程式可分析出最可能是蛋白質(zhì)編碼的序列。
目錄 |
例子
一段5'-UCUAAAGGUCCA-3'序列。此序列共有3種讀取法：
- UCU AAA GGU CCA
- CUA AAG GUC
- UAA AGG UCC
由于UAA為終止編碼，因此第三種讀取法不具編譯出蛋白質(zhì)的潛力，故只有前兩者為開放閱讀框架。
找ORF的軟件
在線尋找ORF的軟件：ORF Finder
功能
ORF Finder 被用來預(yù)測已存在的編碼區(qū)的小基因序列。也可用于大規(guī)模的開放式閱讀框尋找。
參見
外部連結(jié)
- Translation and Open Reading Frames - A Site explaining Open Reading Frames
- NCBI ORF finder - A web based interactive tool for predicting and analysing ORFs from nucleotide sequences.
- ORF finder - A web based interactive tool for predicting and analysing ORFs from nucleotide sequences - hosted at bioinformatics.org
- Sequerome - A Sequence profiling tool that links each BLAST record to the NCBI ORF enabling complete ORF analysis of a BLAST report
- StarORF - 多平臺， Java根據(jù)，為預(yù)言和分析ORFs和得到反向補(bǔ)全序列的GUI工具
參考來源
出自A+醫(yī)學(xué)百科 “開放閱讀框”條目 http://m.wanqianlive.com/w/%E5%BC%80%E6%94%BE%E9%98%85%E8%AF%BB%E6%A1%86 轉(zhuǎn)載請保留此鏈接
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